海外メディア「GameSpot」は、コナミと小島プロダクションの確執を原因に、2015年9月1日に発売される「メタルギアソリッドV ファントムペイン」完成後に同社を退社すると報じた。
小島監督を含む小島プロダクションの一部上層スタッフの雇用形態が正社員から契約社員へ切り替えられており、インターネットやメール、電話の利用が制限されているとのこと。
また、同時に「小島プロダクション」の公式ツイッターアカウントが廃止となり、MGSV:TPPの公式サイトから、小島プロダクションのロゴマークや「A Hideo Kojima Game」の文字が消えている。
コナミの広報は、「小島は現在も社員として在籍しております」と契約社員への切り替えや「小島プロダクション」と確執など一連の報道を否定。小島氏の今後の退社の可能性については「今後については分からないし、誰も、小島自身も分からないと思います」と話した。
臆測を呼んだロゴの削除などの変更へは「制作体制が変更となり、小島プロダクションなど社内プロダクション制度をやめ、本部制へと改変したため」と同プロダクションがなくなったための措置と説明する。
小島監督の雇用形態が契約社員に変更されたという情報については、「社員個人の雇用形態については、小島に限らずお答えできない」との回答だった。